Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SH3BP4Q9P0V3 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SH3BP4Q9P0V3 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SH3BP4Q9P0V3 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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