Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LTBP3Q9NS15 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms