Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXQ1Q9C009 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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