Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TPRNQ4KMQ1 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TPRNQ4KMQ1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TPRNQ4KMQ1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
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