Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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CCDC142Q17RM4 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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