Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKN1Q16512 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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