Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNGA3Q16281 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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CNGA3Q16281 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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CNGA3Q16281 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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CNGA3Q16281 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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CNGA3Q16281 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CNGA3Q16281 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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