Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNCBQ16143 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNCBQ16143 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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