Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC85BQ15834 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC85BQ15834 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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