Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SURF1Q15526 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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