Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPNMBQ14956 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPNMBQ14956 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms