Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SMCO1Q147U7 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMCO1Q147U7 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
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