Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
COL4A6Q14031 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
COL4A6Q14031 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
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