Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CACNA1CQ13936 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms