Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H3Q13889 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GTF2H3Q13889 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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