Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RUNX3Q13761 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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