| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1132P-201 | ENST00000459214 | 107 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFLAR-AS1-202 | ENST00000474886 | 223 nt | TSL 3 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP445-201 | ENST00000515889 | 115 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-115P-201 | ENST00000516433 | 55 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA27.4-201 | ENST00000516650 | 95 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007991.3-201 | ENST00000517623 | 502 nt | TSL 4 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011604.1-201 | ENST00000545978 | 196 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4709-201 | ENST00000577272 | 72 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005357.1-201 | ENST00000588399 | 301 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003357.1-201 | ENST00000604497 | 148 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC242852.1-201 | ENST00000612151 | 96 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021506.2-201 | ENST00000612354 | 169 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR548AY-201 | ENST00000617669 | 107 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U4.1-201 | ENST00000620349 | 87 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244015.1-201 | ENST00000622301 | 99 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OSBPL1A-217 | ENST00000638614 | 84 nt | TSL 5 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRA1P-203 | ENST00000535939 | 2353 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR424-201 | ENST00000362227 | 98 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.44-201 | ENST00000362676 | 108 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.288-201 | ENST00000364854 | 92 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1323P-201 | ENST00000384025 | 107 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-514P-201 | ENST00000384208 | 107 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1289P-201 | ENST00000384431 | 106 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1031P-201 | ENST00000384773 | 107 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR520G-201 | ENST00000385064 | 90 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU11-5P-201 | ENST00000391216 | 129 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | FTH1P12-201 | ENST00000432137 | 551 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02534-201 | ENST00000446525 | 283 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-34P-201 | ENST00000459394 | 64 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005908.1-201 | ENST00000468701 | 347 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR9P1P-201 | ENST00000496431 | 281 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003097.2-201 | ENST00000530126 | 178 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC127455.1-201 | ENST00000565496 | 145 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoU18.1-201 | ENST00000629629 | 71 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAA50-211 | ENST00000630058 | 177 nt | TSL 5 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHST9-202 | ENST00000581714 | 2043 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIF1A-212 | ENST00000557538 | 3468 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161722.3-201 | ENST00000605789 | 2983 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.60-201 | ENST00000362831 | 98 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-414P-201 | ENST00000363705 | 104 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-10P-201 | ENST00000364383 | 140 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-41P-201 | ENST00000364426 | 143 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.277-201 | ENST00000364754 | 102 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-702P-201 | ENST00000364982 | 107 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.307-201 | ENST00000365022 | 117 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.539-201 | ENST00000384635 | 107 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1302-3-201 | ENST00000408128 | 138 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1278-201 | ENST00000408753 | 81 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP200-201 | ENST00000410564 | 320 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024067.1-201 | ENST00000426199 | 223 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z98949.2-201 | ENST00000440996 | 144 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL583859.1-201 | ENST00000455871 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGLVVI-22-1-201 | ENST00000521183 | 211 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC040936.1-201 | ENST00000534543 | 172 nt | TSL 5 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512605.2-201 | ENST00000592972 | 256 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POLR3GP1-201 | ENST00000594073 | 261 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC037487.3-201 | ENST00000606668 | 112 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC062037.2-201 | ENST00000610137 | 73 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL078604.3-201 | ENST00000615580 | 211 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591926.4-201 | ENST00000616895 | 298 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GNPDA2-204 | ENST00000509756 | 5382 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIRLET7C-201 | ENST00000362160 | 84 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.76-201 | ENST00000362931 | 109 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.253-201 | ENST00000364562 | 112 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA72-201 | ENST00000384339 | 132 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR562-201 | ENST00000384894 | 95 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1267-201 | ENST00000408723 | 78 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CALM2P4-201 | ENST00000430810 | 426 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353743.2-204 | ENST00000456242 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1116P-201 | ENST00000517269 | 99 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002004.2-201 | ENST00000531656 | 154 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3128-201 | ENST00000581957 | 66 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL078603.1-201 | ENST00000603824 | 313 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011921.3-201 | ENST00000605540 | 361 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013791.1-201 | ENST00000616619 | 62 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01790-201 | ENST00000447194 | 2852 nt | TSL 2 BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRD1-203 | ENST00000430130 | 2661 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZGRF1-208 | ENST00000505019 | 6652 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR302D-201 | ENST00000362275 | 68 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-93P-201 | ENST00000364704 | 169 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-338P-201 | ENST00000383888 | 105 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-211P-201 | ENST00000384047 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA36B-201 | ENST00000410438 | 131 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.621-201 | ENST00000411065 | 96 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP30-201 | ENST00000454092 | 297 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS29P29-201 | ENST00000456396 | 171 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD2.1-201 | ENST00000458762 | 69 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL39P38-201 | ENST00000467018 | 153 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP54-201 | ENST00000495129 | 419 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD116-28-201 | ENST00000516123 | 91 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP220-201 | ENST00000516298 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-56P-201 | ENST00000516826 | 190 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL358944.1-201 | ENST00000528537 | 144 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160236.1-201 | ENST00000556317 | 195 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | hsa-mir-548d-2.1-201 | ENST00000582790 | 97 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNQ1OT1_5.1-201 | ENST00000621902 | 226 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HFM1-201 | ENST00000370425 | 4931 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |