Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ALCAMQ13740 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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