Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
FHL3Q13643 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
FHL3Q13643 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms