Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CUL4AQ13619 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CUL4AQ13619 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms