Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NEUROD1Q13562 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEUROD1Q13562 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
NEUROD1Q13562 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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