Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BFSP2Q13515 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BFSP2Q13515 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms