Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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