Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MSLNQ13421 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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