Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KLF1Q13351 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KLF1Q13351 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms