Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PTGDRQ13258 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PTGDRQ13258 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms