Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CALCOCO2Q13137 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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CALCOCO2Q13137 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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CALCOCO2Q13137 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
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