Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NR1H3Q13133 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NR1H3Q13133 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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