Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ACACAQ13085 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ACACAQ13085 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.1 ms