Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF1Q13077 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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