Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms