Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EFEMP1Q12805 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.58□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.57□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.54□□□□□ -2
EFEMP1Q12805 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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