Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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GTF3C1Q12789 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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GTF3C1Q12789 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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GTF3C1Q12789 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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