Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SOBPA7XYQ1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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