Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GDE1Q9NZC3 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GDE1Q9NZC3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms