Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1Q9NPL8 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms