Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP9Q99956 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP9Q99956 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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