Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms