Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms