Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
UBXN4Q92575 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBXN4Q92575 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 965.8 ms