Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms