Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf135Q5VTT2 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf135Q5VTT2 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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