Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CTXN3Q4LDR2 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CTXN3Q4LDR2 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms