Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KNOP1Q1ED39 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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