Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
RTL8BQ17RB0 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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