Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HIF1AQ16665 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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