Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HERC1Q15751 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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