Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
LAPTM4AQ15012 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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