Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SHPRHQ149N8 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHPRHQ149N8 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms