Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMC1AQ14683 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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