Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NEDD9Q14511 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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